- Inria
- Palaiseau
Doctorant F/H Utilisation de dossiers médicaux électroniques pour établir des modèles statistiques pronostics et prescriptifs pour améliorer la prise en charge de patients atteints de diabète de type 2.
Contexte et atouts du poste Dans le cadre du projet européen NTERCEPT-T2D (Médecine interceptive basée sur l’inflammation dans le diabète de type 2), l'équipe-projet SODA collabore avec plusieurs parteniaires académiques et industriels européens pour améliorer la prise en charge de patients atteints de diabète de Type 2. En effet, cette pathologie est très hétérogène, ce qui complique la prédiction du devenir des patients et le choix de la prise en charge la plus adaptée à chacun selon ses caractéristiques cliniques. L'accès aux données médicales s'inscrit dans le cadre d'un partenariat avec l'entropôt de données de santé de l'APHP (groupement des hôpitaux parisiens).Le projet se fera en étroite collaboration avec le service de diabétologie de l'Hôpital Bichat (APHP), le département de santé publique de l'Hôpital Pitié Salpêtrière et le service de Sciences des Données de l'EDS de l'APHP, pour compléter l'expertise de l'équipe-projet SODA sur les données médicales et les outils techniques de l'EDS.L'objectif est de proposer et développer des méthodes statistiques adaptée aux données de dossiers médicaux complexes (mélange de données structurées et non structurées, potentielles erreurs de saisie, données manquantes, séries temporelles irrégulières) pour d'un part mieux prédire l'évolution du diabète vers d'éventuelles complications et permettre aux soignants d'identifier les patients à risque, et d'autre part pour identifier des pratiques médicales permettant d'améliorer la prise en charge des patients. Dans ce dernier volet, on s'intéressera en particulier aux caractéristiques inflammatoires des patients, et à l'impact potentiel de traitements anti-inflammatoires, afin d'obtenir des mesures en soin de "vie réelle" qui viendront compléter les approches expérimentales des autres partenaires du projet. Mission confiée Missions :Sous la supervision de Gaël Varoquaux et Judith Abécassis, la personne recrutée sera chargée d'effectuer une veille bibliographique des développements méthodologiques pertinents pour les différents projets de ce travail de doctorat, mais aussi de pouvoir proposer de nouvelles approches, à mettre en oeuvre dans le cadre applicatif.Le ou la doctorant(e) devra communiquer ses avancées avec les différents partenaires du projet, qui seront selon les cas des experts en mathématiques et sciences des données, ou des experts en médecine, biologie et physiologie.Enfin, le ou la doctorant(e) participera à la vie de l'équipe et à son animation scientifique (séminaires d'équipe, groupes de travail thématiques, entraide). Principales activités Principales activités :- veille technologique et bibliographique- développement et mise en oeuvre rigoureuse des méthodologies développées (code modulaire, documenté, testé)- écriture et publication d'articles scienfiques ou d'autres moyens de diffusion (conférences, présentations)Activités complémentaires (3 maximum) :- communication scientifique auprès de l'équipe SODA et des partenaires du projet Compétences Compétences techniques et niveau requis : bonne maîtrise des statistiques et du machine learningbon niveau en Python et familiarité avec les principales librairies de programmation scientifiques (pandas, scikit-learn) Langues : la maîtrise du français est un plus pour la bonne compréhension des données du projet. Avantages Restauration subventionnéeTransports publics remboursés partiellementCongés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travailÉquipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)Accès à la formation professionnelleSécurité sociale Rémunération 1ère et 2ème année : 2082€ brut/mois3ème année : 2190€ brut/mois